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是一种小型的细小病毒，通常为二十面体结构，不含包膜。野生型AAV基因组为线性单链DNA，大小约4.7kb，两端分别具有T形反向末端重复序列（ITR），用作病毒复制的起点和包装信号。AAV中的Rep基因编码四种蛋白质（Rep78，Rep68，Rep52和Rep40），在病毒复制过程中起关键作用。同时，Cap基因负责编码三种衣壳亚基，通过可变剪接和翻译产生衣壳蛋白（capsid protein）VP1，VP2和VP3。这些蛋白以1：1：10的比例组装成成熟的AAV颗粒，直径约26nm。
重组腺相关病毒载体（Recombinant adeno-associated virus, rAAV）
是通过改造野生型AAV的基因组而制成的基因载体。在设计rAAV载体时，编码区的基因序列会被替换为目的基因和相关功能片段，同时保留两端的反向末端重复序列。生产过程通常采用三质粒共转染法，之后可用于侵染细胞。rAAV具有种类多样、极低免疫原性、高安全性、广泛宿主细胞感染范围（包括分裂和非分裂细胞）、强扩散能力以及长时间体内基因表达等特点，因此被认为是最具前景的基因研究和基因治疗载体之一。
腺相关病毒的衣壳蛋白存在不同的突变型，导致出现多种AAV亚型，可根据血清试验结果分类。目前已确认的AAV亚型超过196种，其中在灵长类动物中已鉴定到13种不同的血清型（AAV1至AAV13）。AAV2、AAV3和AAV9等亚型源自人类体内。AAV2是最早被克隆的亚型，也是研究最深入并应用最广泛的病毒载体之一。研究表明，不同血清型的AAV可以发生杂交，产生兼具双方特点的新型AAV亚型。目前常用的rAAV是通过组合AAV2型基因组与不同衣壳蛋白的结合而制成的混合体病毒载体，常标记为rAAV2/N（N代表不同的血清型）。这种重组病毒具有AAV2型的稳定表达和基因整合能力，同时具备不同血清型的组织感染特异性，展现出一定的器官靶向特性。
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