备注:本产品中 Blood-Direct Real-Time Competitive Allele-Specific Detection Master Mix (2×)包含低浓度 ROX,适用于如下型
号 Real Time PCR 仪:
- Applied Biosystems 7500 Real-Time PCR System (Thermo Fisher Scientific);
- Applied Biosystems 7500 FAST Real-Time PCR System (Thermo
产品描述:
本产品 可针对血卡 或血斑样本,无需进行核酸提取, 采用竞争性等位 基因特异性扩增 原理和方法,进 行 SNP 基 因 分 型 检 测 。 本 产 品 预 混 液 (Blood-Card-Direct Real-Time Competitive Allele-Specific Detection Master Mix, 2×)中已经包含检测所需要的通用探针,客户只需根据检测位点设计两条位点特异性引物及一条 下游引物即可开展实验。使用新型通用探针可以进行实时荧光检测。
使用试剂盒中特殊的 Buffer BCL03 组分,对血卡样本进行简单预处理后直接进行竞争性等位基因特异 性扩 增反应,所得 SNP 分型 检测的结果可媲 美以核酸提取后的高纯 DNA 产物 作为模板的反应效果,具有
节省操作时间和降低费用的显著优点。
本产品中使用了经过定向改造和抗体封闭的直扩型热启动聚合酶(Hot-Start DNA Polymerase),配合条件 优化的热启动专用缓冲体系,对血卡样本中的 PCR 抑制物具有极强的耐受性,可有效避免类似于非热启动 型聚合酶导致的非特异性扩增反应,从而提升 PCR 扩增效率。同时也能够针对不同 GC 含量的基因完成扩 增,获得理想的分型结果。
产品特点
1.无需核酸提取或者纯化,直接对血卡样本进行竞争性等位基因扩增反应检测 SNP,省时省力;
2.预混液(Master Mix, 2×)中所含通用探针可以进行实时荧光检测,用户仅需设计普通引物即可,大大降低 检测成本;
3.使用本试剂盒进行竞争性等位基因扩增反应效果可媲美以高纯 DNA 提取产物作为模板的反应效果;
4. 可以进行 Hot Start 法 PCR 反应,具有高扩增效率、高扩增灵敏度的特点;
5. 可针对高 GC 含量片段进行有效扩增,扩增能力强。
扩增体系和条件
1. 样本前处理
1)向 0.2 mL EP 管(或 96 孔 PCR 板)中加入 50 µL Buffer BCL03;
2)用剪刀(或者打孔器)剪取 1~2 片 2 mm 尺寸的干血片,加入到 Buffer BCL03 中,瞬离确保干血片完全浸入到液体中;
3) 将 EP 管于 95℃下加热 5min 后,置于平板离心机 4000g 离心 2min(或台式离心机 12,000RPM 离心 2min ),可直接吸取 上清液作为 PCR 反应模板使用。
2.反应体系构建
备注:
*1:可预先将检测引物按照下表配置方法,配置成 72× Primer Mix:
*2:建议模板加入量为总反应体积的 10~30%,优选加入量为 20% ,请勿超过 30% 。如需加入更多量模板请与本公司 技术人员联系;样本若需要长期保存请将上清液置于-20℃保存。
3.反应程序
*1: Touch-down ,65~57 ℃, 每个循环下降 0.8℃;
*2:通用探针的荧光基团分别为 FAM 和 VIC,进行荧光收集时需选择该两个通道。若选择终点法收集荧光,请设置在 30℃, 1 min 进行。
应用实例
使用本试剂盒,对 44 个血液样本进行处理后,使用直接竞争性等位基因扩增方法对两个位点(rs429358 和 rs1801131)进行 SNP 基因分型,实验结果显示成功分型,且 cluster 集中于预设区域。
注意事项
1.预混液(Master Mix, 2×)使用前上下轻柔颠倒数次,确保各试剂成份完全混匀,并短暂离心收集试剂至容 器底部,试剂如未充分混匀可能导致反应性能下降;
2.Master Mix 置于 4℃的保存时间不应超过 1 周,长期保存置于-20℃;
3.配制 PCR 反应 Mix,依次加入各成份后需涡旋混匀并进行短暂离心;
4.Master Mix 对光敏感,应避免长时间和强光照射;
5.本产品仅供科学研究使用。